由于我國迄今未能建立起適應投資基金特點的稅收政策體系,，三種組織形式的投資基金均面臨嚴重的稅收問題。
1,、將契約型公募證券基金視為個人投資者征稅,。導致機構(gòu)投資者需承擔額外稅負：契約型私募基金則處于稅收盲區(qū)。按照企業(yè)所得稅法,，法人企業(yè)投資于包括上市公司在內(nèi)的法人企業(yè),，股息紅利作為稅后收益無需繳稅；公益機構(gòu)的投資收益原本也屬于免稅收益,。但是,，機構(gòu)通過基金投資上市公司時，基金取得的股息紅利需比照個人投資者,，由上市公司代扣代繳股息紅利稅,，就需承擔額外的股息紅利稅。規(guī)模龐大的契約型私募基金則由于不進行工商登記,，一直處于稅收征管盲區(qū)：不僅基金不作為納稅主體,，投資者也不繳稅。
2,、將公司型基金視為法人企業(yè)征稅,，導致雙重征稅,。一是基金需繳納企業(yè)所得稅，二是投資者個人還需再繳納個人所得稅,，兩個環(huán)節(jié)合計稅負高達40%,。
3、將合伙型基金視為一般合伙企業(yè),。導致國家稅收政策面臨無法實施的尷尬境地,。地方普遍施行越權(quán)減免稅政策。
基于目前的投資基金征稅亂象,，亟待重構(gòu)投資基金所得稅體系,。筆者建議：
1、對符合投資管道條件的各類基金,，統(tǒng)籌考慮給予稅收透明體待遇,。雖然企業(yè)所得稅法規(guī)定法人企業(yè)是企業(yè)所得稅的納稅人，但依據(jù)該法第三十六條,，國務院有權(quán)以稅收優(yōu)惠方式,，特別規(guī)定符合投資管道條件的公司型基金由投資者繳納所得稅。
2,、暫宜統(tǒng)一由基金管理機構(gòu)為個人履行代扣代繳義務,，切實防范各類避稅行為。
3,、配合推出資本利得稅,，鼓勵進行長期投資。對投資未上市企業(yè)滿3年的,，其轉(zhuǎn)讓股權(quán)所獲得的資本利得,，建議減半征稅；對投資滿5年的,，建議減按l/4征稅,。對證券基金轉(zhuǎn)讓上市股票的所得，鑒于目前股市狀況,，可考慮繼續(xù)暫免征稅,。
4、改進創(chuàng)投基金應納稅所得抵扣政策,，將享受抵扣主體從基金轉(zhuǎn)為投資者,。將各類符合投資管道條件的投資基金視為非納稅主體，在投資者環(huán)節(jié)繳稅后,，就可將現(xiàn)行創(chuàng)投基金應納稅所得抵扣政策的享受主體從基金轉(zhuǎn)為投資者,。如此統(tǒng)籌設計后，稅收優(yōu)惠政策的效果就不會被雙重征稅大打折扣,，將之推廣到其他組織形式也不再存在加劇稅負不公問題,。(摘自《中國社科院要報》)